Glossar

Das Exom repräsentiert weniger als 2 % des menschlichen Genoms, enthält allerdings ~85 % der bekannten krankheitsverursachenden genetischen Varianten in den proteinkodierenden Regionen. Anwendungen finden sich in Populationsstudien, Krebsstudien und der Untersuchung genetisch bedingter Erkrankungen. Daher ist die Exomsequenzierung die kostengünstige Alternative zur Genomsequenzierung (Whole Genome Sequencing, WGS).

ATLAS Biolabs bietet gezielte Resequenzierungen als kostengünstige Alternative zur Genom- und Exomsequenzierung (WGS bzw. WES) an, um in kundenspezifischen, genomischen Zielregionen genetische Varianten zu detektieren. Das jeweilige Design entwirft ATLAS Biolabs in enger Absprache mit dem Kunden.

Die Chromatin Immunopräzipitations (ChIP)-Sequenzierung ermöglicht die akkurate Analyse von Interaktionen zwischen Proteinen und der DNA oder RNA. Die ChIP-Sequenzierung liefert damit die Grundlage zur Interpretation essentieller, zentraler Regulationsmechanismen vieler biologischer Prozesse und Krankheitsbilder.

Die RNA-Seq (RNA sequencing) Technologie erlaubt die Erforschung und Profilierung des Transkriptoms in beliebigen Organismen. RNA-Seq ermöglicht die Entdeckung neuer Transkripte, Genfusionen, Einzel-Nukleotidvarianten, InDels (kleine Insertionen und Deletionen) und weitere zuvor unbekannte Veränderungen. Mit Hilfe der Small RNA-Seq kann in jeder Probe jede kleine RNA oder miRNA samt Variationen und differentiellem Expressionsprofil analysiert werden. Darüber hinaus können neue miRNAs und andere kleine nicht-kodierende RNAs detektiert werden.

Transkriptomanalysen auf Gen-, Exonebene sowie für kodierende und nicht-kodierende Regionen.

Die Microarray-basierte Analyse von Expressionsprofilen liefert umfangreiche Ergebnisse zur Genaktivität in biologischen Proben diverser Spezies. Als kostengünstiges Hochdurchsatzverfahren können innerhalb kurzer Zeit qualitativ hochwertige Daten in großen Studien zur differentiellen Genexpression generiert werden. Weitere Anwendungen sind die Klassifizierung von Krankheiten, die Pathway Analyse, die Kartierung von expressionsbasierten quantitativen Trait Loci (eQTL) und viele mehr. Selbst Proben mit geringsten Ausgangsmengen, z. B. FFPE-Proben, können in unserem Service problemlos eingesetzt werden.

Der von Life Technolgies (Affymetrix) bzw. Agilent zertifizierte Genexpressionsservice der ATLAS Biolabs beinhaltet neben Microarrays für: Mensch, Maus und Ratte viele weiter Microarrays zu Modellorganismen. Mit Hilfe spezieller Affymetrix-Assays können zur RNA-Seq vergleichbare Ergebnisse in schneller, sensitiver und validierter Weise erzielt werden. Diese Assays ermöglichen die Analyse der differentiellen Exon-spezifischen Genexpression des gesamten Transkriptoms und damit die Analyse von vielen tausend, verschiedenen Transkript-Isoformen. Agilent Custom Microarrays können bereits ab einer Stückzahl von einem Objektträger bestellt werden. Wir übernehmen für Sie auch die Erstellung des kundenspezifischen Designs oder unterstützen Sie bei der kostenlosen Erstellung des Designs in Agilent eArray.