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ATLAS Biolabs - Bioinformatik

Bioinformatik

Mit unserer statistischen und bioinformatischen Expertise sowie unseren umfangreichen Erfahrungen im Software-Engineering (DIN EN 62304) kümmern wir uns um Ihre Projekte von der Anforderungsanalyse bis zur Datenauswertung und Berichterstellung. Wir realisieren mehrjährige Projekte im streng regulierten Umfeld der Pharmaindustrie, aber auch kleine Einzelprojekte .


Expressionsanalysen

Für Ihre Microarray-Daten (Thermo Fisher Scientitic/Affymetrix oder Agilent) erstellen wir statistische Analysen inklusive eines umfangreichen Berichtes zu den signifikant differentiell exprimierten Genen. Dafür sind mindestens zwei Vergleichsgruppen und zwei Proben pro Gruppe notwendig. Im Zuge der Auswertung werden die Daten normalisiert und verschiedene Grafiken zur Qualitätskontrolle erstellt (MvA-, Volcano-, Cluster-, PCA-Grafiken). Für alle Transkripte bzw. Gene erhalten Sie Tabellen mit log2-Ratios, p-Werten und den Signalintensitäten.

Affymetrix-Daten können Sie bei Bedarf auch selbst mit der Transcriptome-Analysis-Console von Thermo Fisher Scientific/Affymetrix analysieren. Gerne unterstützen wir Sie dabei.

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NGS-Auswertungen

Unsere etablierten NGS-Auswertungen von DNA- oder RNA-Sequenzierungen (Whole-Genome-Sequencing, WGS, Whole-Exome-Sequencing, WES, Transkriptom) bieten unterschiedliche Möglichkeiten und können entsprechend Ihren Spezifikationen angepasst werden. Das ermöglicht eine hohe Flexibilität, um Ihre Anforderungen zu erfüllen. Wir prozessieren auch Daten aus Xenograft-Material. Alle Phasen des Analyseprozesses unterliegen strengen Qualitätskontrollen. Die Ergebnisse werden für Sie übersichtlich und verständlich in unserem webbasierten Kundenportal aufbereitet und stehen Ihnen dort zum Download zur Verfügung.

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Präzisionsmedizin

Für genetische Abweichungen erstellen wir Ihnen individuell auf den Einzelfall zugeschnittene Berichte. So können Zusammenhänge zwischen genetischen Veränderungen und dem beobachteten Krankheitsbild sichtbar werden – unter anderem bei der Untersuchung von Erbkrankheiten, genetischen Risikoprofilen, Immunantworten und Verstoffwechslung von Medikamenten.

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