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ATLAS Biolabs - Bioinformatik
Expressionsanalysen
Für Ihre Microarray-Daten (Thermo Fisher Scientitic/Affymetrix oder Agilent) erstellen wir statistische Analysen inklusive eines umfangreichen Berichtes zu den signifikant differentiell exprimierten Genen. Dafür sind mindestens zwei Vergleichsgruppen und zwei Proben pro Gruppe notwendig. Im Zuge der Auswertung werden die Daten normalisiert und verschiedene Grafiken zur Qualitätskontrolle erstellt (MvA-, Volcano-, Cluster-, PCA-Grafiken). Für alle Transkripte bzw. Gene erhalten Sie Tabellen mit log2-Ratios, p-Werten und den Signalintensitäten.
Affymetrix-Daten können Sie bei Bedarf auch selbst mit der Transcriptome-Analysis-Console von Thermo Fisher Scientific/Affymetrix analysieren. Gerne unterstützen wir Sie dabei.
Lieferumfang
Bericht im PDF-Format: Tabelle mit bis zu 100 signifikant differentiell exprimierten Genen, verschiedene Abbildungen: MvA-, Cluster-, Vulcano-Plot, Principal-Component-Analysis (PCA)
Daten: Tabellen mit allen log2-Ratios, p-Werten und Signalintensitäten sowie Annotationen als CSV-Dateifür Ihre eigenen Filterungen und Auswertungen
Hochauflösende Abbildungen zur weiteren Verwendung, z.B. in Veröffentlichungen
Weitere Analysen,Tabellen und Abbildungen nach Absprache.
